전공자를 위한 생물학/생화학

[생화학] 2.7 : 단백질의 농도, 단백질의 활성

단세포가 되고파🫠 2024. 11. 4. 23:50
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이번 포스트에서는 단백질의 농도를 재는 방법에 대해 알아보고, 이어서 단백질의 활성도에 대해 알아보자.

 

 


한편 Tyr, Trp 등의 aromatic amino acid는 280nm 근방 UV를 잘 absorb함. (즉, Tyr, Trp는 굉장히 강한 chromophore임. 이 때 chromophore란 빛을 absorb해서 밖으로 발색하는 물질을 의미함) 이와 관련된 상당히 중요한 law가 바로 Lambert-Beer law임.

 

 

이를 이용할 시 Absorbance A를 계산 가능함. 이 때 c는 molar concentration을 의미하고, l은 sample을 loading한 cubic의 폭, 즉 빛이 지나간 path의 length를 의미함.

 

 

 

 

위 그림은 Try, Trp의 흡광 패턴을 나타내주고 있음. 이들 둘의 흡광 패턴을 보아도 알 수 있는 것처럼, 단백질의 흡광도는 거의 대부분 Trp와 Tyr의 흡광 패턴에 의해서 달라지게 됨.

 

 

 

 

한편, 기본적으로 단백질의 activity는 protein의 function 정도를 의미함. (즉, activity는 function of protein) 그리고 specific activity는 activity를 전체 protein concentration으로 나눈 것임. 즉, protein mixture 전체에 대해서 activity를 가지는 protein이 어느정도나 있는지를 나타내주는 값이라 할 수 있음.

 

 

 

 

위 graph를 보면 검은 삼각형은 activity를, 흰색 사각형은 protein의 농도를 보여주고 있음. 그런데 이 때 앞쪽 부분의 경우 protein의 농도는 높은 반면 activity는 거의 0임. 즉, 이 부분의 specific activity는 거의 0에 가까움. 한편 뒤쪽(fraction 18 정도)의 경우 protein의 농도와 함께 protein의 activity도 높음. 즉, 이 곳의 경우 specific activity가 1에 가까울 것임. 따라서 specific activity가 1에 가까운 이 fraction 부분을 간추려내는 것이 더 타당할 것임.

 

 

 

 

 

위 그림에는 specific activity와 관련된 간략한 모식도가 나타나 있으므로 참고할 것.

 

 

 

다음 포스트에서는 protein sequencing에 대해 조금 더 알아보도록 하자.

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