놀면서 공부하기

2021.04.25 - [전공자를 위한 생물학/세포생물학] - [세포생물학] 5.2 : signal sequence & gated transport 1 - NPC, NLS, Importin, Ran GTPase [세포생물학] 5.2 : signal sequence & gated transport 1 - NPC, NLS, Importin, Ran GTPase 이번 포스트부터는 본격적으로 단백질이 경유할 수 있는 pathway들 중 한 종류인 gated transport에 대해 자세히 알아보도록 할게요. 우선 이에 앞서 signal sequence라는 개념에 대해 알아둘 필요가 있어 unicellular.tistory.com 이전 포스트에서는 핵막에 있는 NPC, cargo protein에 있는 NLS, N..

이번 포스트부터는 본격적으로 단백질이 경유할 수 있는 pathway들 중 한 종류인 gated transport에 대해 자세히 알아보도록 할게요. 우선 이에 앞서 signal sequence라는 개념에 대해 알아둘 필요가 있어요. signal sequence는 단백질 내부에 있는 일종의 꼬리표라고 볼 수 있어요. 다리 말해서 리보솜(ribosome)에서 합성된 protein들이 세포 내 어디로 가서 위치하게 될지를 나타내주는 정보인 것이죠. signal sequence는 크게 signal peptide와 signal patch의 두 종류로 나눌 수 있어요. 위 그림 위쪽과 같이 단백질의 아미노산 서열 중 일부 연속된 서열이 단백질의 주소(adress)를 나타내는 것이 바로 signal peptide이고,..

이번 포스트에서는 세포의 구성요소, 세포소기관, 세포내 단백질의 이동 등에 대해 알아보도록 할게요. 원핵생물(prokaryotic cell)과는 달리 진핵생물(eukariotic cell)들은 아래와 같이 세포 내에 지질막으로 둘러싸인 세포소기관(organelle)들이 존재해요. 그렇다면 이런 세포소기관들이 존재해서 진핵생물이 얻을 수 있는 장점은 무엇일까요? 다양한 장점이 있을 수 있겠지만, 가장 큰 장점은 각각의 세포소기관 내에서 특이적인 반응을 할 수 있다는 거에요. (호랑이와 사슴을 같은 우리에서 키울 순 없지만, 이 녀석들을 공간적으로 분리된 데 둔다면 쉽게 키울 수 있겠죠? 그거랑 비슷한 이유에요) 그렇다면 도대체 이런 세포소기관들은 어떻게 형성된 것일까요? 사실 이와 관련해서는 지금도 의견이..

이번 포스트에서는 고등학교 생명과학 1의 맨 첫 번째 등장하는 내용인 생명현상의 특성에 대해서 알아볼게요. 생명과학이라는 과목을 본격적으로 이해하고 배우기 이전에, 일단 생명과학에서 다루는 '생명체'라는 대상이 무엇인지에 대해 명확히 알 필요가 있어요. 다시 말해 길가다 마주치는 전봇대(무생물)와 사람(생물)이 도대체 어떤 점에서 다른지에 대해 이해하는 것이 필요한거죠. 기본적으로 생명체는 무생물과는 달리 아래에 나열된 것과 같은 독특한 특징들을 가지고 있어요. 1. 세포(cell)로 구성되어 있다. 2. 물질대사(metabolism)를 한다. 3. 자극에 대해 반응하고, 그 결과 항상성(homeostasis)을 유지한다. 4. 발생하고 생장한다. 5. 생식을 통해 자손에게 형질을 유전한다. 6. 주어진..

직전 포스트에서 세포막을 구성하는 지질에 대해 살펴봤는데요. 이번 포스트에서는 이런 지질들에 의해 달라질 수 있는 세포막 유동성(fluidity), 비대칭성(asymmetry) 등에 대해 알아보고, 이에 더해 세포막에서 관찰되는 아주 독특한 구조인 지질 뗏목(lipid raft)에 대해 알아볼게요. 우선 세포막 유동성에 대해 먼저 알아볼게요. 언뜻 생각하기에 세포막 내의 인지질이 마치 하드케이스처럼 딱딱하게 존재하고 있겠다고 생각할 수도 있는데요. 실제로는 위 그림에 나타나 있는 것처럼 다양한 방법으로 움직이고 있어요. 세포막 내에서 인지질 분자가 움직이는 방식은 크게 4가지로 분류되는데, 1) lateral diffusion(평형 확산) 2) rotation, 3) flexion, 4) flip-flo..

이번 포스트부터는 세포막(Cell membrane)에 대해 본격적으로 알아볼게요. 다들 세포(cell) 하면 위와 같은 이미지를 떠올리실텐데요. 이 중 세포의 맨 가장자리 부분에 있는 막을 세포막(cell membrane)이라고 부르죠. 이 막은 엄청나게 중요한데요. 세포 막이 있으므로 비로소 세포막 안쪽을 '세포 내부'라고 정할 수 있겠죠? 따라서 세포의 형태 그 자체에 있어서도 매우 중요하고요. 그 밖에 세포막을 통해서 각종 물질들이 들락날락하기 때문에, 세포막은 일종의 검문소 역할도 수행해요. 자, 그럼 이러한 세포막을 구성하고 있는 대표적인 성분은 무엇인가? 하고 누가 물어본다면, 인지질, 콜레스테롤, 단백질 정도를 말해주면 아주 틀린 건 아니에요. 물론 그 밖에도 당지질, 당단백질을 비롯한 수많..

저번 포스트에서는 간단히 형광현미경의 원리에 대해 알아봤었는데요. 이번 포스트에서는 형광 현미경을 이용해서 단백질들의 동역학(protein dynamics)에 대해 연구할 수 있는 방법에 대해 알아볼게요. 1. FRET 첫 번째로 알아볼 방법은 FRET(fluorescence resonance energy transfer, 혹은 Förster Resonance Energy Transfer)이에요. 풀네임이 길어서 거부감이 느껴지실수도 있을 것 같은데요..ㅋㅋㅋ 사실 저 풀네임 안에 FRET의 작동원리가 다 요약되어 있는거라서 주의깊게 볼 필요가 있어요. FRET의 이름을 해부해 보자면, fluorescence(형광)현상을 바탕으로 일어나는 resonance(공명)이 있고, 공명을 통해 에너지가 특정 분자..

이번 포스트에서는 정제한 단백질을 분석(analyze)하는 방법에 대해 알아보도록 할게요. 본격적으로 시작하기에 앞서, 단백질을 분석할 수 있는 방법은 엄~~~~~~~~~청 많다는거를 아셔야 해요 ㅋㅋㅋㅋㅋ 그 중에서 아주 기본 중의 기본에 해당하는! 세포생물학을 배웠는데 이걸 모르면 욕먹을만한! 그런 몇 가지 방법들에 대해서만 알아보도록 할게요 사실 이 마저도 하나하나를 깊이있게 알아보려면 너무 많은 배경지식이 필요하기 때문에, 나중에 아예 실험기법들만 따로 모아서 포스트로 작성해보려고 계획하고 있어요. 그러니 본 포스트에서는 느낌 정도만 알아보는 걸로 하죠 ㅋㅋ 1. SDS-PAGE 첫 번째로 알아볼 녀석은 바로 SDS-PAGE에요. 보통 대학에서 생물학 실험 같은 과목을 수강하시게 되면 SDS-PA..

이번 포스트에서는 단백질을 정제하는 방법에 대해 알아보려고 해요. 아니, 앞에서 계속 세포 이야기만 하다가 갑자기 뜬금없이 단백질?? 하고 생각하시는 분들도 있겠지만.. 결국 세포 내에 존재하면서 세포가 기능할 수 있는 이유는 단백질 때문이에요. 따라서 우리가 세포의 기능을 알고 싶다! 혹은 세포의 작동원리를 알고 싶다! 하면 단백질을 조사해봐야 해요. 일단 단백질을 조사하려면 세포 내에 있는 단백질을 꺼내는 작업이 필요하겠죠?? 이를 위해서 말 그대로 세포를 깨부수는, 세포 파쇄(cell lysis) 과정을 진행해줄 수 있어요. 세포 파쇄를 하는 방법은 다양한데요! 삼투압을 이용한 물리적인 방법으로 세포를 펑 터뜨려벌리 수도 있고 계면활성제 같은 녀석들을 이용한 화학적인 방법으로 세포를 녹여버릴수도 있..

본 글을 포함한 세포생물학 카테고리의 글은 고등학교 수준 이상의 생명과학 지식을 가지고 있는 학생들을 대상으로 하고 있으며, 대학에서 세포생물학을 수강하고 있는 학생, 혹은 세포생물학에 관심이 있어 미리 공부하려고 하는 학생들이 읽기에 적합한 수준으로 작성되었습니다. 세포생물학 시리즈를 시작으로 훨씬 기초적인 내용부터 훨씬 advance된 내용까지를 아우를 예정이니 기대해주시면 감사하겠습니다. 그렇다면 세포생물학이란 구체적으로 어떤 것을 탐구하는 학문일까요? 일단 '세포생물학'이라는 이름을 보시면 '세포'라는 단어와 '생물학'이라는 단어가 합쳐져 있다는 걸 쉽게 아실 수 있텐데요. 쉽게 말해 세포생물학은 세포 수준에서 일어나는 복잡미묘한 일들을 생물학적인 방법으로 알아내는 학문이다~라고 이해하시면 충분합..