놀면서 공부하기

지난 포스트에 이어서 살펴보자.   위 그림은 앞서 배웠던 fatty acid의 β-oxidation 과정임. 그런데 흥미롭게도, fatty acid synthesis 과정은 거의 이 반응의 역반응과 유사함.  fatty acid synthesis의 한 round, 즉 2 carbon의 acetate가 하나 첨가될 때의 round에서는 크게 4가지 반응이 일어나는데, condensation, reduction, dehydration, reduction이 바로 그것임.    그 과정은 대략 위 그림과 같음. 하나하나 살펴보자. 보면 일단 처음에 acetyl group이 KS의 thiol group에 결합된 상태이고, 새로 loading될 malonyl group이 ACP의 thiol group에 결합된 상..

이번 포스트부터는 지방산(fatty acid)의 생합성 과정에 대해 자세히 알아보자.  fatty acid의 경우 한 번에 하나의 acetate unit(2C)이 첨가되는 반응이 반복해서 일어난 결과 합성될 수 있음. 이 때 새로 첨가되는 acetate unit은 malonate의 activation된 form인 malonyl-CoA로부터 제공됨.    malonyl-CoA의 구조는 위와 같음. 보면 오른쪽의 acetyl group에 왼쪽의 CO2가 첨가되어있는 모양새임.  한편 앞서 fatty acid synthesis 과정에서 NADPH가 필요하다고 했었음. 그렇다면 이 NADPH는 어떤 반응들로부터 얻어질 수 있을까. 우선 animal cell, 그 중에서도 adipocyte의 경우 pentose ..

이번 포스트부터는 lipid의 생합성에 대해 알아보자.  lipid는 다양한 biological function을 수행함. 예를 들어 lipid는 energy storage, membrane 구성, membrane protein의 anchor, enzyme의 cofactor, signaling molecule, pigment detergent, transporter, antioxidant 등으로 기능할 수 있음.    위 그림에 나타나 있는 것은 metastasis 이후 자리를 잡은 cancer cell이 주변 세포에 분비하는 signaling molecule들인데, 이 때 분비하는 PGE, LPA, S1P와 같은 물질들은 모두 lipid의 일종임.   앞서 fatty acid의 catabolism 과정..

이번 포스트에서는 plant에서 당을 전달할 때 가장 typical하게 사용되는 sucrose가 어떻게 합성되는지에 대해 살펴보자. 일단 앞서 살펴봤던 것처럼 DHAP와 G3P가 aldolase에 의해서 fructose 1,6-bisphosphate(F1,6BP)로 합쳐지게 됨. 이어서 F1,6BP는 F1,6-bisphosphatase(FBPase)에 의해 dephosphorylation되고 그 결과 F6P가 만들어짐.    이어서 위와 같은 일이 일어남. 보면 우선 F6P와 UDP-glucose가 sucrose 6-phosphate synthase에 의해 합쳐져 sucrose 6-phosphate가 만들어짐. (이 때는 또 ADP-glucose가 아니라 UDP-glucose가 사용된다는 것을 유의할 것..