놀면서 공부하기

지난 포스트에 이어서 당 대사의 조절과정에 대해 살펴보자.    한편 위 그림에는 myocyte에서 일어나는 glycogen synthesis 반응이 나타나 있음. 결국 이 반응은 insulin에 의해 촉진되는데, 이 때 촉진되는 step들이 다양함. 보면 GLUT4를 통해 세포 내로 들어오는 glucose의 양이 insulin에 의해 촉진되고(구체적으로는 GLUT4를 세포막에 더 많이 분포되게 하고), glucose가 hexokinase에 의해 G6P로 바뀌는 반응도 insulin에 의해 촉진되고(구체적으로는 hexokinase의 expression 양을 늘리고), 마지막으로 UDP-glucose가 glycogen이 되는 반응에 관여하는 glycogen synthase라는 효소가 insulin에 의해 ..

이번 포스트부터는 당 대사의 조절 과정에 대해 자세히 살펴보자.   이전에 살펴봤던 것처럼 ATP, AMP는 매우 중요한 cellular regulator로 작용함.    이 때 특히나, ATP는 매우 abundant한 반면 AMP는 매우 적게 존재함. 따라서 위 표에 나타나 있는 것처럼 ATP의 양이 10%만 줄어들어도 AMP는 600% 늘어나게 됨. 따라서 이처럼 매우 dramatic하게 변화하는 AMP는 regulation에 매우 유용하게 사용될 수 있음.  그렇다면 AMP는 구체적으로 어떻게 pathway들에 영향을 미칠 수 있을까.     AMP가 결합하는 대표적인 단백질은 AMP-activated protein kinase(AMPK)임. 이 단백질에 AMP가 allosteric하게 결합할 시 ..

이번 포스트부터는 앞서 배운 당 대사들이 어떤 식으로 우리 몸에서 조절되는지에 대해 알아보도록 하자.  metabolic pathway들은 각각의 의의와 역할이 있는데, 어떤 반응은 energy를 extract하는 목적을, 다른 반응은 fuel을 저장하는 목적을, 그 밖에 building block을 합성하는 목적을, 그 밖에 waste material을 제거하는 목적을 바탕으로 작동하는 반응들도 있음.    metabolic pathway는 위 그림에도 나타나 있는 것처럼 서로서로 밀접하게 연관되어 있음. (즉, 각각의 pathway가 나머지와 independent하게 존재하는 것이 아니라 매우 밀접하게 연관되어 있음)  metabolic pathway의 regulation에 있어서는 feedback ..

이전 포스트에 이어서 pentose phosphate pathway(PPP)에 대해 살펴보자.    흥미롭게도, PPP의 결과 생긴 NADPH는 위 그림에서와 같이 PPP의 첫 번째 반응을 block하는 역할을 해 negative feedback을 형성할 수 있음. 그 결과 glycolysis가 더 많이 일어나게 됨. (참고로 실제로는 NADP+가 PPP 첫 반응의 allosteric activator로 작용하므로, NADPH가 생성될 시 이 activation 효과가 덜해져서 PPP의 첫 반응이 잘 안일어나게 되는 것임)     위 그림에는 생성된 NADPH가 어떻게 oxidative stress에 대한 저항성을 부여해줄 수 있는지에 대해 묘사되어 있음. 보면 mitochondrial respirati..

이번 포스트부터는 pentose phosphate pathway(PPP)에 대해 알아보자.     위 그림에는 PPP가 나타나 있음. PPP의 시작물질은 G6P이며, 이 녀석이 6-phosphogluconate가 되면서 NADPH가 생성되고, 여기서 CO2가 빠지며 ribulose 5-phosphate가 되는 과정에서 NADPH가 한 분자 더 생성되고, 이 녀석이 다시금 ribose 5-phosphate가 되게 될 시 이렇게 만들어진 ribose 5-phosphate는 nucleotide, coenzyme, DNA, RNA 등의 합성원료로 쓰이게 됨. 이런 과정을 PPP의 oxidative phase라 함. 한편 ribulose 5-phosphate는 다시금 transketolase, transaldol..