놀면서 공부하기

이제 axon에 대해 본격적으로 알아보자. axon은 neuron에서 정보전달의 통로 역할을 함.   일단 axon의 시작부위, 즉 action potential이 생성되는 시작부를 axon hillock이라 부름. 이어서 axon proper(middle), axon collateral(branch) 부위가 있으며, 가장 말단부에는 axon terminal이 존재하고 있음.  전통적으로는 axon에 ER이 존재하지 않으며 protein synthesis도 일어나지 않는다고 알려져 있었음. 그러나 최근 axon에서 mRNA들이 많이 존재하며, 이들이 실제로 protein으로 합성되는 사례가 보고되고 있어 이에 대한 진위여부가 불투명한 상태임.    한편 위 그림은 axon terminal 부분의 구조를 ..

이번 포스트에서는 neuron들의 기본적인 특징에 대해 조금 더 알아보자.    neuron은 위 그림과 같이 구성되어 있음.  이들도 cell이기 때문에 당연히 cytosol이 내부에 존재하며, mitochondria, nucleus 등의 organelle등도 다 존재함. 이 때 대부분의 organelle들은 soma 부위에만 존재하고 있음. 물론 예외는 있는데, mitochondria는 axon terminal에도 존재하고 있음.     한편 neuron에서도 여전히 central dogma의 원리에 따라 protein들이 합성됨.   그렇다면 도대체 gene contents는 동일한데도 다른 세포와 비교했을 때 neuron의 형태, 기능이 이토록이나 달라지는 이유는 무엇일까.     일단 위 그림에..

neuron과 glia는 뇌를 이루고 있는 두 가지의 대표적인 세포군임.   과거 아리스토텔레스는 심장을 정신의 원천으로 생각한 반면, 이후 Descartes는 brain이 정신의 원천이라고 주장함.  한편 cell theory가 주장되고, 다양한 증거를 통해 입증되면서 brain도 cell로 이루어져 있으며, brain cell의 brain function의 basic unit이라는 것이 정설로 받아들여지게 됨.  이 때 세의 structure를 알면 곧 이로부터 function을 유추할 수 있고, 다양한 cell들 간에 일어나는 communication에 대해서도 이해할 수 있으므로 뇌과학자들은 이에 대해 많은 관심을 기울여 연구함. (특히나 cell들간에 일어나는 상호작용에 의해 sensation,..

이번 포스트에서는 glia, 즉 신경교세포와 neuron, 그리고 뇌에 대해 대략적으로 살펴보도록 하자.  glial cell은 크게 microglia와 macroglia로 나뉘어짐. 이 중 microglia는 phagocyte로부터 유래했으며, neuroinflammatory reaction을 수행함. 한편 macroglia는 다시 oligodendrocyte, schwann cell, astrocyte로 나뉘어짐. 이 중 oligodendrocyte는 CNS에서만 발견되고 schwann cell은 PNS에서만 발견됨. 이 둘은 각각 CNS, PNS에서 axon을 insulate해줌.   이제 다음으로 brain의 해부학적 구조에 대해 조금 더 알아보자.    일단 1번 위치는 척수(spinal cor..

이번 포스트에서는 번역 신장의 3번째 단계에 대해 알아보자.   앞서 살펴 두 step이 완료되고 나면 ribosome은 peptidyl-tRNA를 A site에 가지고 있고, P site에는 deacylated tRNA가 존재하고 있음. 이 때 elongation의 3번째 step으로 translocation이 일어나야 함. 이 때의 translocation은 mRNA와 peptidyl-tRNA를 한 codon length만큼 움직여주는 작업을 뜻함. 이 과정이 일어나면 peptidyl-tRNA는 P site에 위치하게 되고 deacylated tRNA는 E site로 이동한 뒤 ribosome으로부터 eject됨. 이 과정에는 EF-G factor가 매우 중요하게 작용하며, 특히 EF-G와 함께 붙어..

이번에는 번역 신장의 두번째 단계에 대해 알아보자.    elongation에서 두 번째 step은 바로 peptidyl transferase에 의한 peptidyl transfer임. 앞서 말한 것처럼 본 과정은 기본적으로 ribosome 내의 rRNA에 의해 유발됨. 이에 대한 증거가 아래 실험 결과임.    일단 본 실험에서는 fMet-puro 생성물의 양을 파악하는 assay를 통해서 fMet에 puromycin이 첨가되었을 때 정상적으로 peptidyl transfer가 일어나는지 여부를 확인함.  그리고 본 실험에서 사용한 두 가지 종류의 ribosome이 있는데, 바로 E70S와 T50S임. 전자는 E. coli로부터 유래했으며 후자는 thermophilic bacteria로부터 유래함. 일..

이번 포스트에서는 지난 포스트에 이어서 구체적으로 elongation의 첫 번째 단계에 대해 살펴보도록 하자.   앞서 살펴봤듯이 elongation의 첫 번째 step은 aminoacyl-tRNA가 ribosome의 A site에 결합되는 것임. 이 과정에서 EF-Tu, aminoacyl-tRNA, GTP가 합쳐져서 만들어지는 ternary complex가 생기게 됨. 그렇다면 이런 complex가 생긴다는 것은 어떻게 알게 되었을까.      위 그림은 labeling한 GTP, labeling한 Phe를 이용해서 수행한 gel filtration 결과를 보여주고 있음. 그 결과 fraction number 20 부근에 GTP, Phe-tRNA가 많이 관찰됨을 확인함. 물론 위 그림에는 나타나 있지 ..

이번 포스트부터는 본격적으로 번역 신장 과정에 대해 자세히 알아보도록 하자.     전체적인 elongation cycle 모식도는 위와 같음. elongation cycle은 크게 3개의 step으로 나누어지는데, 아래와 같음.    1. EF-Tu(with GTP)에 의해 aminoacyl-tRNA가 ribosome의 A site에 binding  2. ribosome 내 RNA를 center로 해서 구성되는 peptidyl transferase에 의해 P site에 있는 peptide와 A site에 새로 들어온 aminoacyl-tRNA의 amino acid 사이에 peptide bond가 형성 (ribosome 내 protein들은 대다수 ribosome의 구조 유지 자체에만 도움을 줌)  3...

이번 포스트부터는 단백질 번역에서의 신장 과정에 대해 알아보도록 하자.   기본적으로 elongation 과정은 bacteria와 eukaryote에서 매우 비슷함. (둘 다 뒤에서 다시 살펴볼 EF-T, EF-G factor가 중요하게 사용됨)   translation elongation에 대해 잘 모르던 과거에는 polypeptide가 N→C 방향으로 합성되는지, C→N 방향으로 합성되는지를 잘 몰랐고, ribosome이 RNA를 읽어나가는 방향도 몰랐으며, 어떻게 해서 mRNA로부터 단백질이 만들어지는지의 과정도 잘 몰랐었음.   그런데 연구를 통해 ribosome이 mRNA를 5'→3' 방향으로 읽어나가고, 이 과정에서 합성되는 단백질은 N→C방향으로 합성된다는 것을 알게 됨.    위 그림에 나..

안녕하세요. 오늘은 대학원생들이 입학 후 직면하게 되는 가장 큰 위기 중 하나인 랩미팅을 어떻게 준비해야 하는지에 대해 알아보도록 할게요.     랩미팅은 명시적으로 정해진 형식이 없고, 실험실에 따라서 방식도 다 다르기 때문에 대학발표나 회사 발표와는 다르게 준비하는데 있어 더 막막할 때가 많아요.   그렇기에 본 글에서는 랩미팅 준비에 있어 중요하다고 생각되어지는 몇가 간단한 체크리스트들을 바탕으로 랩미팅 준비를 잘 할 수 있는 법에 대해 알아보고자 해요.   1. 랩 단위, 혹은 본인 프로젝트 단위에서의 목표를 명확히 명시하기  실험실은 기본적으로 과제비를 바탕으로 운영되는 시스템이므로, 교수님을 포함한 랩의 핵심인력들은 앞으로 랩이 나아가아할 방향, 그리고 랩이 지향해야 할 비전을 매순간마다 고민..