[유전학] 10.4 : proteomics, systems biology

 

이번 포스트에서는 proteomics와 systems biology에 대해 간략히 알아보자.

 

 

 

 

위 그림에는 2D 전기영동의 모식도와 예시 결과가 나타나 있음. 보면 protein들을 일단 pH에 따라 1D로 분리한 후 90도 돌려서 다시 SDS-PAGE를 수행함. (이 때 SDS는 protein에 균등한 charge를 입혀주는 역할을 하므로 결국 SDS-PAGE를 통해서는 크기에 따라서만 protein을 차등적으로 분리할 수 있음)

 

 

이후 이렇게 분리된 특정 point의 sample을 뽑아서 mass-spectrometry를 진행함. 이 때 mass-to-charge ratio(m/z ratio)를 측정하여 sample의 구성성분을 알아내게 됨.

 

 

 

 

참고로 MS 중에서도 위 그림에 나타나 있는 MALDI(matrix-assisted laser desorption ionization)가 꽤나 많이 사용됨. 이 떄 MALDI의 경우 matrix가 대부분의 energy를 흡수하므로 소량의 energy만 sample을 때리게 되고 그 결과 fragmentation이 일어나지 않음. 이런 MS 방법을 이용할 시 protein의 amino acid sequence까지도 알아낼 수 있음.

 

 

 

systems biology는 genomics, transcriptomics, proteomics와 그 외 다른 생물학 영역으로부터 얻어진 다양한 data들을 결합시켜서 이들간의 상호작용 pathway의 주요인자들을 밝혀내거나, 아니면 이들 분자간의 상관관계에 대해서 밝혀내는 연구분야임.

 

 

 

 

 

위 그림에 이런 식으로 밝혀낸 분자들간의 상관관계가 나타나 있음. 이 때 이렇게 밝혀진 상관관계를 interactome이라고 부름.

 

 

 

다음 포스트부터는 발생유전학에 대해 알아보자.